Aqui me estás diciendo algo diferente...
de acuerdo a lo que veniamos hablando, obtenías los datos directamente en Excel desde MySQL, algo que se puede hacer por ODBC. Pero lo que me dices ahora es que
exportas los datos desde MySQL y luego los abres en Excel.
Bueno, si lo que tienes es una query que ejecutas en MySQL y luego exportas para Excel, la UNICA SOLUCION que tienes es exportar lo mismo, pero EN ETAPAS, a dferentes archivos, cada uno llevando un segmento de datos.
¿Se entiende?
Es decir
Luego:
Y después:
Y asi sucesivamente...
Lo que MySQL NO tiene es una query que sea capaz de generar N archivos diferentes, cada uno conteniendo una parte de un mismo resultado de un SELECT.