Gracias Profesor_Falken 
Siguiendo tus instrucciones he conseguido que funcione (por lo menos en modo debug) 
Me ha surgido otro problema, y es que, en el código, se lee el usuario y contraseña para la página donde tiene que conectarse de un fichero de texto, que está en formato:
usuario = pepe
contraseña = pepa 
Y lo lee con este código: 
Código:
      this.properties = new Properties();
     try {
              this.properties.load(getClass().getClassLoader().getResourceAsStream("cierre.properties"));
          } catch (IOException ex) {
               ex.printStackTrace();
          }
  el problema es que no reconoce esta sentencia: 
Código:
               this.properties.load(getClass().getClassLoader().getResourceAsStream("cierre.properties"));
  por lo que yo la he cambiado para leer el fichero en formato secuencial y separar el contenido de cada línea en partes. 
He utilizado la sentencia tokenizer, junto a FileReader y BufferReadeer, modificando el código hasta llegar a esta parte: 
Código:
  String a;
 String b;
 while( ( linea = buff.readLine() ) != null ) {
  //Aqui dentro manejamos la linea
	 StringTokenizer st = new StringTokenizer(linea,"=;",true);
     	if(st.countTokens()>2){
     			a=st.nextToken();
     			b=a.replace(" ","");
     			a.replaceAll("\\s","");
     			System.out.println(a); 
     		
         		if(a.indexOf("usuario")>=0){
         			st.nextToken();
         			a=st.nextToken();
         			b=a.replace(" ","");
         			a.replaceAll("\\s","");
         			a="pepe"; // esto lo he puesto para que funcione en la prueba
         			properties.setProperty(CIERRE_USER, a);
         		}
         		if(a.indexOf("clave")>=0){
         			st.nextToken();
         			a=st.nextToken();
         			b=a.replace(" ","");
         			a.replaceAll("\\s","");
         			a="pepa"; // esto lo he puesto para que funcione en la prueba
         			properties.setProperty(CIERRE_PASS, a);
     		}
     	}
     	System.out.println(linea);    
 }
  El problema es que los parámetros recogidos llevan algo delante y detrás que impiden el funcionamiento correcto.  Para la prueba he colocado los valores manualmente, pero eso invalida el fichero y la facilidad de cambiarlos en el futuro sin tener que retocar el código. 
Cuando veo los valores con el debug, aparecen como " pepe " y " pepa ", por lo que está claro que falta algo en la sentencia replaceAll para eliminarlo. 
¿Que puedo hacer para que me queden limpios los valores "pepe" y "pepa"?
o ¿Hay otra opción mejor para hacer la separación? 
Un saludo
José Antonio Gracia