Hola:
No sé exactamente que pretendes. Hay una librería
http://doc.sikuli.org/index.html en la que capturando previamente trozos de pantalla (por ejemplo, capturar la imagen de un botón de una aplicación), es capaz de estar pendiente de si vuelven a aparecer o no para relalizar tareas, (como hacer click sobre él) o cualquier otra cosa.
Se bueno.