¿Ejecutar script php y detenerlo inmediatamente?

[xerifandtomas]

Pero que es lo que almacenas en esas 2 carpetas o son directorios vacíos, ¿copias algo ahí dentro? por que por las operaciones que dices 15 segundos me parece un tiempo excesivo, para eso.

Intenta revisar los tiempos de respuesta con firebug o alguna otra aplicación, por que puede ser que tu lentitud sea debido a otra cosa.

Si realmente es problema de tu Script depuralo porque esos tiempos me parecen muy altos.