Bueno, como no creo que nadie se atreva a leer un post de hace más de 5 años entonces ¿por qué no comienzas por mostrar el código que tienes y los problemas que te da?
Es decir, no existen limitaciones para borrar un archivo basado en la longitud de la extensión, así que sería ridículo pensar que sí las hay.
Sin saber lo que has hecho es imposible ayudarte.