Y si te haces un define PHP? Trabaja siempre con defines y te facilitará las cosas a la hora de mover las cosas entre servidores.
Además te evita cualquier posible problema con el tema de las URL amigables.
Ejemplo:
Código PHP:
//website
define("PATH", "http://".$_SERVER['SERVER_NAME']."/");
Código PHP:
//local
define("PATH", "localhost/mi_proyecto/");
Código PHP:
<a href='<?php echo PATH; ?>carpeta_uno/archivo.php'></a>