Consulta me duplica datos

[Libras]

Si te fijas bien en tu consulta no repite datos, porque porque tienes 2 valores diferentes:

----------Cantidad----Concepto--Contrario
Pago1: ----15---------A---------Paco
Pago3: ----70---------B---------Paco

estos son registros diferentes, no iguales porque el concepto y cantidad son diferentes aunque sean del mismo nombre si quieres hacer la consulta como dices que aparezca un nombre podrias discriminar tu resultada obteniendo nada mas el que tenga fecha maxima :)

Código MySQL:

SELECT expedien.nexp,linpag.descripcio,linpag.concepto,SUM(linpag.cantidad),contra.nombre
FROM expedien
LEFT JOIN pagos ON expedien.nexp=pagos.nexp
LEFT JOIN linpag ON pagos.npagos=linpag.npagos
LEFT JOIN conexp ON expedien.nexp=conexp.nexp
LEFT JOIN contra ON conexp.ncon=contra.ncon
left join (select max(fecha), concepto from expediente group by concepto) as nueva on (linpag.fecha=nueva.fecha and linpag.concepto=nueva.concepto)
WHERE (linpag.fecha > CAST("2016/01/01" AS DATE)) 
GROUP BY linpag.concepto, contra.nombre