Bueno.. por si a alguien le sirve, encontré una manera.
Utilicé shell_exec y al final añadi 2>&1 y utilicé preg_match.
Código PHP:
Ver original<?php
$xyz = shell_exec("ffmpeg -i \"{$videofile}\" 2>&1");
$search='/Duration: (.*?),/';
$explode = explode(':', $matches[1]); echo 'Hour: ' . $explode[0];
echo 'Minute: ' . $explode[1];
echo 'Seconds: ' . $explode[2];
?>
Eso extrae la duración de un video con PHP y FFMPEG.