Pues este mensaje:
Cita: Esta tabla no contiene una columna única. Funcionalidades relacionadas con la edición de la grilla y los enlaces de copiado, eliminación y edición pueden no funcionar luego de guardar.
Sólo aparece cuando le falta un identificador único (PK o clave UNIQUE).
MySQL ni miente ni se equivoca.
¿No estarías editando OTRA tabla diferente en ese momento?
Si no es así, deberás replicar todo el error, es decir REPETIR la prueba intentada y ver si se produce nuevamente. Porque lo que muestras no se condice con lo que dices.