Supongo que tienes algo así:
http://codepen.io/g3kdigital/pen/zrNbMz?editors=110
Pues que te digo, posición fixed precisamente no obedece a ningún contenedor, solo a las dimensiones del viewport. Creo que debes replantearte si usar esa propiedad.
Ahora, sí no puedes cambiar tu mismo el position:fixed, porque se genera externamente o por X razón, lo que se me ocurre es que fuerces al banner a ser position:relative usando !important, si descomentas el código que esta en link, lo veras por ti mismo.