Duda sobre cómo manejar una tabla de relaciones

[dehm]

Bueno, como siempre tengo la sensación de que no he puesto un título muy afortunado. A ver si me explico mejor ahora:

Parto de una tabla que relaciona otras dos. Esta tabla tiene 3 columnas, la id, la id de una de las tablas y la id de la otra tabla (en una relacion de M:N)

Bueno, pues mi duda es que si en algún momento he de romper alguna relación, se me queda un hueco "vacío"...vamos, que las id ya no son correlativas. Entonces, cuando vuelva a crear otra relación.....¿he de aprovechar esa id o he de seguir a partir de la última?

Obviamente sé que va a funcionar de las dos formas, pero no sé si es una buena práctica o no el "aprovechar" las id que van faltando en lugar de ir siempre añadiendo id desde la última que haya.

Saludos y gracias!