Coloca un if que evalúe si el campo está vacío:
Código PHP:
Ver originalIf (!$registropoblacion['poblacion']=="")
{
echo "<option value='{$registropoblacion['poblacion']}'> {$registropoblacion['poblacion']}</option>";
}
Algo así sería. Trata de adaptarlo pq lo estoy haciendo desde el celular y no sé si funcione tal cual como está.