Hola! Integer78 yo tenia el mismo problema hace dias y pude solucionarlo de esta forma:
Solo debes editar el archivo .htaccess de tu sitio web y pegar este codigo en el archivo
Código:
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} *^www.ejemplo.com*[nocase]
RewriteRule ^(.*) * * * http://ejemplo.com/$1*[last,redirect=301]
lo guardas, despues de subirlo notaras la redireccion, tu sitio web ya no mostrara las www sino redireccionara a ejemplo.com con ello google dejara de mostrar la advertencia en los proximos dias!
en la Fuente lo explican mas detallado, por si es de ayuda la dejo aca:
(...)
saludos