No estoy seguro de si te va a servir, pero el script que yo uso es PPhlogger:
http://phpee.com/
Es lo mejor que he encontrado. Te da estadísticas muy completas, y además visitantes activos, contador de descargas, etc.
Utiliza PHP+MySQL y es gratis. Tienes más detalles en el apartado 'Estadísticas muy completas, y gratuitas...' en:
http://www.recursosvoip.com/webmasters/index.php