AlvaroG eres un crack!!
Efectivamente de esa forma, lo pude hacer.
Lo que hice básicamente fue crear un link desde las carpetas /etc/rc6.d para apagar y /etc/rc0.d para reiniciar y funciono correctamente.
Dejo los pasos para un próximo forero que lo necesite:
Añadir al archivo
Cita: /etc/lightdm/lightdm.conf
la siguiente linea:
Cita: session-cleanup-script=/path/to/script
Después de añadir esta línea, hay que salir del modo gráfico, pulsando CTRL+ALT+F1 y reiniciar el lightdm
Cita: sudo service lightdm restart
NOTA: El script debe comenzar llamandose
k99_loquesea_nombre_script donde k99 es la prioridad.
Despues, hacer ejecutable con el siguiente comando:
Cita: sudo chmod +x K99_loquesea_nombre_script
Eso es todo!!
Saludos!