unlink() y rmdir()
usa
www.php.net/nombrefuncion y verás su descripción y sintax de uso ..
Con esas funciones borras archivos y directorios ... Si deseas borrar directorios antes deberás borrar sus archivos. Para ello con el objeto dir() por ejemplo puedes leer el directorio -> almacenarte tus nombres de archivos de ese directorio y aplicarle al bucle que uses para leer ese directorio/array generada tu unlink() .. En el manual de PHP (en esas funciones) tienes ejemplos ..
Un saludo,