Php, telefono o dispositivo y codigo QR

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no vas a invocar automáticamente un script de php desde un qr por razones de seguridad, como te dije te estas enrollando de mas, otra cosa, no estas explicando mucho, primero quien genera el QR??? el cel del empleado o el equipo en la porteria??, segundo que data habria en el QR que pretendas que ejecute automaticamente un php??? cosa que no va a pasar, debes simplificar más el asunto, ahora desde una aplicacion nativa en android si podrias hacer que despues de leer un QR este envie la info mediante un get al servidor y que en el servidor se ejecute la consulta y este emita la respuestas que esperas, pero es complicarse de mas