Te muestra algún mensaje de error al intentar insertar el registro? Y si antes de generar el query reemplazas NOW("") por una variable así:
Código PHP:
Ver originalfunction insertardocumentos($id, $nom_archivo)
{
$obj_modelo=new sQuery();
$fecha = date("Y-m-d H:i:s");
$query="INSERT INTO documentos1 (documento, fecha_adjunto, cod_proyecto) VALUES ('$nom_archivo', '$fecha', '$id')";
$obj_modelo->executeQuery($query); // ejecuta la consulta
return $query .'<br/>Registros afectados: '.$obj_modelo->getAffect(); // retorna todos los registros afectados
}
No veo en qué otra cosa pueda estar fallando.