Basicamente,
Javascript se ejecuta del lado del cliente, y php del lado del servidor, o sea, hace un script en php que te devuelva mediante un echo la hora del servidor en el formato que vos quieras, y luego tenes que realizar una función en javascript que mediante AJAX consulte al script creado en php
Código:
function obtenerHoraServidor()
{
var xmlhttp;
if (window.XMLHttpRequest)
{// code for IE7+, Firefox, Chrome, Opera, Safari
xmlhttp=new XMLHttpRequest();
}
else
{// code for IE6, IE5
xmlhttp=new ActiveXObject("Microsoft.XMLHTTP");
}
xmlhttp.onreadystatechange=function()
{
if (xmlhttp.readyState==4 && xmlhttp.status==200)
{
//la respuesta la va a colocar en el div myDIV - Asegurate de tenerlo en index.html / index.php
document.getElementById("myDiv").innerHTML=xmlhttp.responseText;
}
}
xmlhttp.open("GET","tuScript.php",true);
xmlhttp.send();
}
Lo unico que tenes que hacer es setear un intervalo de tiempo para llamar a la función obtenerHoraServidor
Espero haber ayudado.
Saludos,