Utiliza un contador para los id y añadele el evento onclick directamente al elemento, asi podrás pasarle el id por parametro:
Código PHP:
<?php
$cont = 0;
while( $row = mysql_fetch_assoc($result_5)){
echo "<td>";
if ($row['user'] > '0') {
$ver_user = '<div>
<a id="ver_user'.$cont.'" onclick="verUser('.$cont.')">'.$row['user'].'</a>
<div id="ver_user2'.$cont.'" style="display:none;">
<div id="cerrar_user2'.$cont.'" onclick="cerrarUser('.$cont.')"></div>'.$row['usuario'].'</div>
</div>';
}
echo $ver_user;
echo "</td>";
$cont++;
}
?>
<script type="text/javascript">
function verUser(id){
$("#ver_user2" + id).fadeIn(function(){
$("#ver_user" + id).hide("fast");
});
}
function cerrarUser(id){
$("#ver_user2" + id).fadeOut(function(){
$("#ver_user" + id).show("fast");
});
}
</script>