Hola.
Si estás tan cerca y tienes linea de vista, podrías hacer un enlace WiFi entre ambas sedes. La marca ubiquiti a mi me parece buena y a esa distancia podrías lograr enlaces de hasta 75 Mb sin problemas (Gastarás cerca de 200$, no se si tienes presupuesto
).
Recuerda que si lo que quieres hacer son solo respaldos no es obligatoria una VPN, lo que necesitas es que los equipos clientes se conecten al servidor de respaldos, nada más.
a) Puedes configurar un servidor FTP en tu server 2003 ó mejor instala algún linux.
b) Abre los puertos en tu router y publica el servidor FTP con algún servicio de DNS dinámico. (Si vas a usar la conexión por Internet)
c) Configura conbian backup por FTP (En función si usas Internet o un enlace WiFi para la conexion)
d) Si tu conexión es mala considera los respaldos incrementales.
EDITADO... Los votos son voluntarios y no obligatorios para que los estés pidiendo. No es la primera vez que se te pide no lo hagas y lo seguis haciendo.
Saludos.