Tu código debería ser algo así:
Código PHP:
if ($query->rowCount() > 0) {
while ($row = $query->fetch(PDO::FETCH_ASSOC)) {
$rows[] = $row["item"];
}
$output = implode(",", array_map(function($i) {
return "'{$i}'";
}, $rows));
}
Y tendrías la cadena que buscas dentro de la variable $output. Para que esto te funcione, eso sí, tu consulta debería estar hecha con PDO, preparar la consulta y ejecutarla con los parámetros que quieras. También verás que no estoy comprobado si existe una clave asociativa llamada item ni nada por el estilo. Esto es más un fragmento que pseudocódigo que un ejemplo real.
Más o menos, debería funcionarte así.