Para hacer eso tienes que editar dentro del template que tengas instalado el archivo overall_header.tpl
Aqui te pongo un ejemplo de un enlace que se abre en una ventana nueva:
<td class="row2" nowrap>
<a href="http://www.midominio.com
" TARGET="_blank"><span class="genmed">
La Web</a><span style="color:#345487"> |</span>
<a href="{U_PROFILE}"><span class="genmed">{L_PROFILE}</a>
<span style="color:#345487">|</span> <a href="{U_FAQ}">{L_FAQ}</a>
<span style="color:#345487">|</span> <a href="{U_SEARCH}">{L_SEARCH}</a>
<span style="color:#345487">|</span> <a href="{U_MEMBERLIST}">{L_MEMBERLIST}</a>
<span style="color:#345487">|</span> <a href="{U_GROUP_CP}">{L_USERGROUPS}</a></span>
</td>
si no quieres que se abra en una venta nueva quita este trozo TARGET="_blank"
luego se veria asi en el menu del foro:
La Web| Perfil | FAQ | Buscar | Miembros | Grupos de Usuarios
y donde pone la web pones lo que tu quieras un saludo