Metes todo dentro de un echo y reemplaza las comillas dobles por comillas simples. Algo así:
Código PHP:
Ver original<?php
$row_datos['id'] = $row_datos['id'];
if($row_datos['participa']=='Y'){
echo "Usted ya ha confirmado su participación";
} else {
echo"<form action='$editFormAction' id='form1' name='form1' method='POST'>
<label>
<input name='participa' type='checkbox' id='participa' value='S' />
</label>
<input name='id_papa' type='hidden' id='id_papa' value='$row_datos['id']' />
<label>
<input type='submit' name='button' id='button' value='Guardar' />
</label>
<input type='hidden' name='MM_update' value='form1' />
</form>";
}
?>
Saludos!