Acabo de estar toda el día intentando resolver este problema, porque me daban error de que no se qué cabeceras, las rutas a otros archivos php se estropeaban,...
Pues lo he solucionado todo poniendo:
Código PHP:
Ver originalinclude "../index.php";
echo '<div class=\'cajabonita\'>'
. '<h2>'.$respuesta.'</h2> <br/>'
. '<input type=\'button\' value=\'Aceptar\' onclick=\'ocultar()\'>'
. '</div>'
Y en el index.php he utilizado código PHP para indicar las rutas de los demás archivos con "$_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] y $_SERVER['SERVER_NAME']
Y ya funciona perfecto

¿Qué opinais, está bien hecho?
Es que si lo proceso todo en la misma página, me parece a mí que va a pesar y cargará demasiado tiempo, ¿no?