Insertar registro a dos tablas según la eleccion

[zalito12]

Puedes elegir en que tabal insertas un dato sin ningùn problema, a la hora de ejecutar la consulta, pero para ahorrarte futuros dolores de cabeza te comentaré.

Si tanto profesores como alumnos van a ser usuarios de la web, deberías crear una tabla usuarios que englobe a ambos grupos.
A mayores puedes crear un campo nuevo en esa tabla que indique si es un profesor o un alumno, pero lo que sería todavía mejor para el futuro, imagina que en el futuro hay un rol nuevo en tu web, puedes crear una tabla donde almacenes todos los roles.
Por ejemplo una tabla, Rol, hay puedes añadir nuevos roles si surgiesen y en tu tabla de usuarios añades un campo en que se referencie a la tabla de roles y en función del rol ya puedes dar unos permisos, mostrar unas cosas, etc.

Suerte