Bueno, esto lo configuras desde el archivo de config database.php en donde puedes hacer algo asi:
Código PHP:
//En este array podes definir las BD que queres , de la siguiente manera
$db['default']['hostname'] = "192.168.0.100";
//el resto ...
//Ahora definimos la otra base
$db['otradb']['hostname'] = "192.168.0.101";
#Despues cuando cargas la base de datos en donde la necesites podes hacer lo siguiente:
$db1 = $this->load->database('default', TRUE);
$db2 = $this->load->database('otradb', TRUE);
Espero te sirva, saludos.
PD: Te dejo el link de la documentacion por las dudas:
http://www.codeigniter.com/userguide...onnecting.html