Un poco tarde pero mejor que nunca. Todos los encriptadores de codigo tienen un impacto mayor o menor en el performance. Tal vez utilizar HHVM sea una alternativa mas eficiente o Phalanger (PHP implementado en .NET).
No obstante la necesidad me hizo crear el mio propio... soporta namespaces y todo, excepto Doctrine annotations ya que elimina los comentarios del codigo fuente.
http://alvk4r.users.phpclasses.org/php-obfuscate
Debes correr composer dump-autoload para que el ejemplo funcione. Si no usas composer puedes sustituir el include al autoload de composer e incluir la clase directamente. En el fichero obfuscator.php, linea 5 si mal no recuerdo:
Código PHP:
Ver originalrequire_once(__DIR__ . DIRECTORY_SEPARATOR . "vendor/autoload.php");
Código PHP:
Ver originalrequire_once(__DIR__ . DIRECTORY_SEPARATOR . "src/Obfuscator/PhpObfuscator.php");