SW en .NET ok, pero no funciona en ASP.NET

[Malenko]

El problema yo diría que está más de "base". Aunque el lenguaje sea el mismo, C#, una aplicación de escritorio no se puede convertir a una de asp.net cambiando simplemente el tipo de proyecto. Hay que tener en cuenta muchas cosas que funcionan diferente: el envío de eventos, como funcionan los postback, el ciclo de vida, la forma de mantener el "estado" entre llamadas, etc.

Si lo vais a hacer en asp.net porque es un requerimiento hay que plantearse muy bien la arquitectura y saber bien como funciona la DLL y como va a querer que sea la comunicación con el usuario.