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Iniciado por zerokilled 
buenas...
vas a tener que dar mas detalles. por ejemplo, ¿tienes configurado correctamente la hora y huso horario del pc? ¿como determinas que el valor tiene una hora mas? hice una prueba y no tengo ningun problema. luego de obtener el epoch desde javascript de la hora actual Math.floor(Date.now() /1000) lo comparo con el valor epoch que me devuelve el comando `date +%s` en linux.
Hola zerokilled, muchas gracias por tu respuesta, lamento no haber podido comentar antes
Tenías razón, al tener una hora menos en mi computador (debido al cambio de horario), eso generaba que el metodo me entregara el valor Unix con una hora menos, muchas gracias
De todas maneras dejo la pagina donde realizaba las conversiones para comprobar el valor.
http://espanol.epochconverter.com/