Ejecutar Javascript desde include en 2 niveles

[cejebuto]

Hola buenos dias.

Trataré de ser lo mas breve posible.

Estoy desarrollando un programita web con PHP como base.
Uso obviamente Javascript , el framework del mismo jQuery y Ajax con este framework.

Tengo 3 archivos, uno llama al otro por include, debe ser asi para que exista un orden.

archivo1.php
________________________________________--
//Incluyo el Jquery
<script src="jquery.min.js" type="text/javascript"></script>

//Incluyo mi plantilla (esto es variable )
include 'archivo2.php'
_________________________________


archivo2.php
__________________________________--
//Todo el php fuerte, otros includes a formularios y plantillas html
//llego a un punto que tengo que agregar un AJAX o una función en Jquery o ajax

//Si lo inserto de esta manera :
<!--
<script type="text/javascript">
var i = prompt("Teclea un numero entero");
var j = prompt("Teclea otro numero entero");
alert("La suma de las variables i + j da: " + (i + j));
</script>
-->
//SI FUNCIONA, SI ME EJECUTA EL PROGRAMA

//pero si intento de esta segunda forma
<script src="archivo3.js" type="text/javascript"></script>

//NO FUNCIONA ,NO ME EJECUTA EL PROGRAMA Y ESTA FORMA ES LA QUE NECESITO <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
________________________________________-



archivo3.js
________________________________________
<script type="text/javascript">
var i = prompt("Teclea un numero entero");
var j = prompt("Teclea otro numero entero");
alert("La suma de las variables i + j da: " + (i + j));
</script>
___________________________________


Si , yo se que a lo mejor me equivoqué en las funciones y demas.
pero el punto importante es como hacer que se ejecute mi archivo3.js , que esta incluido en archivo2.php que a la vez esta incluido en archivo1.php .

simple, se que se puede. pero no se como.

Por favor ayuda, muchas gracias.