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Antiguo 23/03/2015, 09:06
edanvar
 
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Plot desde pytable muy grande

Me encuentro con la necesidad de hacer un plot con a partir de unos datos almacenados en un archivo .h5 (pytables).

El archivo tiene unas dimensiones importantes, sobre nos 20GB.

El problema es que al intentar hacer plot de los datos necesarios siempre obtengo
Código Python:
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  1. memory error

Me gustaria aprender alguna tecnica o algun consejo para abordar este tipo de situaciones.

Aqui os dejo lo que yo vengo haciendo:

Código Python:
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  1. f1 = plt.figure()
  2. ax1 = f1.add_subplot(111)
  3. f2 = plt.figure()
  4. ax2 = f2.add_subplot(111)
  5. f3 = plt.figure()
  6. ax3 = f3.add_subplot(111)
  7. f4 = plt.figure()
  8. ax4 = f4.add_subplot(111)
  9.            
  10. ax1.hold(True)
  11. ax2.hold(True)
  12. ax3.hold(True)
  13. ax4.hold(True)
  14.  
  15. for row in tab.iterrows():
  16.     if row['ok'] == 1:
  17.         ax1.plot(row['Q10'], row['Q20'],'.',color='green', alpha=0.2)
  18.         ax3.plot(row['Q11'], row['Q21'],'.',color='green', alpha=0.2)
  19.                        
  20.      ax2.plot(row['QR10'], row['QR20'],'.',color='red', alpha=0.2)
  21.      ax4.plot(row['QR11'], row['QR21'],'.',color='red', alpha=0.2)