Entrar en un bucle, problema por filereader

[Xerelo]

Las probabilidades de que encuentres un tutorial para hacer matrices dinámicas es mínimo, no vas a encontrar un tutorial para todo lo que quieras hacer y menos para cosas tan sencillas y que no tienen ninguna complejidad.

Tú quieres aprender a programar, y eso es precisamente lo que tienes que hacer, aprender a usar las herramientas de las que dispones para resolver problemas.

Profesor_falken ya te ha dado las posibilidades, o "reinicias" el fichero con el BufferedReader o lees el fichero y cuentas las líneas a la vez. A menos que estés usando ficheros de cientos de megas, ¿qué te impide guardar las líneas en un ArrayList?.

Luego ese List lo conviertes en una matriz o en lo que tú quieras.