Creo que he encontrado la solución..
https://support.mozilla.org/es/kb/cm...en-el-servidor
Servidor IMAP
En un servidor IMAP, todos tus mensajes y carpetas se sincronizan entre Thunderbird y tu servidor de correo (por favor lee el artículo sincronización IMAP para ver más detalles). Si lo que necesitas es liberar espacio, deberías considerar las siguientes opciones:
Borra los correos más antiguos, especialmente los más grandes. Ordena tus mensajes por tamaño para detectar fácilmente cuáles son los que ocupan más espacio.
Si deseas guardar una copia de tu correo pero no necesitas almacenar los archivos adjuntos, puedes separar los archivos adjuntos para recuperar más espacio de almacenamiento.
Archiva tus viejos correos. Sin embargo, si simplemente los mueves a otra carpeta dentro del servidor IMAP, no vas a recuperar espacio. Para resolver esto, es necesario establecer la carpeta "Archivos" bajo la cuenta "Carpeta local" y no como una carpeta bajo tu cuenta IMAP.