Mira, se me ocurre que podrías hacerlo de esta manera: dentro de cada una de tus columnas metes una fila (row) y le dices que ocupen todo el espacio (col-md-12) y dentro de la fila donde quieres el espacio le añades un padding con la cantidad de separación que quieres, esto último te sugiero hacerlo mediante un media query en tu hoja de estilos ya que no vas a poder controlarlo mediante alguna clase especial para que se acomode todo correctamente en dispositivos móviles, prueba este código y te va quedar mas claro:
Código HTML:
Ver original <div class="col-md-12" style="background:#f00">col con fondo rojo
</div>
<div class="row" style="padding-left:20px"> <div class="col-md-12" style="background:#069">col con fondo azul
</div>