Buenas,
El descriptor de despliegue es el web.xml
Necesitas también tener en el classpath de la aplicación las librerías que contengan la implementación jax-ws que vas a utilizar.
Para Tomcat, necesitas además definir tu endpoint en el fichero jaxws.xml.
Todos esos ficheros te los suele incorporar Netbeans de forma automática cuando arrancas en local.
Cuando exportas el War debes asegurarte de exportar también todos esos ficheros de configuración y dependencias. Si no, no te funcionará.
Te dejo un tutorial detallado de como desarrollar WS en Tomcat:
http://examples.javacodegeeks.com/en...ces-on-tomcat/
Un saludo