Si su disco tiene ahora el formato NTFS y desea regresar a FAT32 con Win98, simplemente inicie su equipo con el disco de inicio y ejecute la opcion de FDISK, elimine la particion actual que es Particion No DOS, y cree una nueva particion DOS.
Luego formatee y tendra ahora su disco en FAT32.
Si desea tener una particion por ejemplo para XP o Win2000 con NTFS y Otra particion FAT32 con Win98, tambien puede hacerlo en un mismo disco.
Suerte