Hola y Bienvenido:
No sé a qué te refieres cuando pones "popup"... siempre se han abierto con una instrucción "window.open()"... y se cierra con una instrucción close() de la ventana referida...
Si es así como se referencia a los popups desde alguna librería (como jquery), tenías que haber posteado en su foro. Puedes reportar el tema para que lo movamos al foro adecuado.
Saludos
