Hola. Puedes corroborar cual es la versión del Safari?. Si no me equivoco, transition solo es soportado a partir de la versión 7.1 a la 8 (De Yosmite).
Si quieres y para hacer más ligero el archivo css,prescinde de los transitions en el :hover ya que los lee igual y asi la transiciónde retorno no es brusca.
Un saludo y espero haberte sido de ayuda
EDITO: Me equivoqué, transition si que es soportado para versiones anteriores. Yo probaria a lo que te dije antes, quitar los transitions del :hover y mirar.
Un saludo de nuevo