Cuando vos instalás Drupal en tu web te crea un .htaccess que probablemente te esté dando problemas a la hora de agregar nuevas carpetas.
Antes que nada, probaste entrar a la url sin agregar el index.php? Yo el otro día metí una carpeta "beta" en un Drupal de un amigo para hacerle un backup de su web y funcionó bien.
Igualmente podés seguir este tutorial para editar el .htaccess y meter tu carpeta nueva:
http://iannuttall.co.uk/apache/drupalhtaccess/
Saludos.