Una base de datos por Usuario.

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Casi en cualquier DBMS lo mejor es tener la segunda opcion, porque tendrias las mismas tablas para cada base de datos, usuarios con permisos diferentes para cada base de datos, archivos de log, ademas de los mantenimientos que al ser por base de datos te podrian causar dolores de cabeza, ahora hablas del rendimiento en una VLDB, para eso existen herramientas en sql server como son los filegroups y las funciones de particion, asi como el uso de filegroups en read-only para no respaldar toda la base de datos sino simplemenete lo nuevo. soluciones existen el chiste es buscar e informarse mas