Buenas compañero,
Contesto al tema, porque me interesaría también la respuesta, por culturilla... Pero la verdad, jamás he escuchado a nadie acerca de crear un instalador de aplicación WEB, lo más complicado, es configurar el IIS, lo otro aún se podría hacer de alguna forma, pues en escritorio se puede...
APP_Data es una carpeta especial que debes crear en la aplicación web, y dentro de esta, crear un nuevo archivo tipo.. Como te indico en las imágenes:
