como evitar descargar archivo descargado previamente?

[ArturoGallegos]

Lamentablemente No es posible interaccionar con la computadora del cliente, ya que se considera intrusivo, agresivo y de muy alto riesgo... como te comente antiguamente existía la posibilidad en explorer sin embargo se presto a malos usos... y hasta donde se ya no es posible hacer eso hoy día.

Quizás usando navegadores viejos pero dudo que sea una alternativa....

Ahora bien, supongo que tu aplicación es una especie de navegador que utiliza algún motor como firefox, explorer u otro, en cuyo caso lo que podrías hacer es crear una API para que tu aplicación interaccione con tu sistema en lugar de usar el navegador como intermediario.... o en ultima instancia, haz que en la consulta que hace tu aplicación incluya una variable, ya sea post o get.

algo como dominio.com?cliente=x&installed=true

y en tu sitio con PHP esa variable la lees, si no existe o es distinta al valor esperado, haces que se descargue el archivo, caso contrario se considera instalada la aplicación y continua con sus procesos.