uhmm, segun yo veo ahí tienes grub, de modo que es normal que no tengas el fichero lilo.conf
¿Dime una cosa? cuando arrancas el sistema te aparece el menu para seleccionar?
¿Tienes el ficher menu.lst en /boot/grub/?
Creo que no le pasa nada a tu cargador, en todo caso tendrias que volver a cargar grub, pero no te hace falta lilo.
Si necesitas volver a cargar grub, desde consola haz:
#grub-install /dev/hda
y lo tienes de nuevo.
Pero ya te digo que si tu consulta es porque no tenias el lilo.conf, es simple, tu no usas lilo, usas grub...y haces bien amigo.
Saludos