Hola preto,
Bueno definitivamente que el código asume que esta recibiendo ambos valores, prueba con algo así a ver que tal te va:
Código PHP:
Ver original<?php
if ($_POST)
{
if(isset($_POST['txtNom'])) {
$nombre=$_POST['txtNom'];
}
else
{
$nombre="%";
}
...
include '../Sistema/conexion.php';
$sql="SELECT * FROM alumnos WHERE Cedula like '$cedula' or Nombre like '$nombre'";
...
}
?>
Y para que envías los checkbox si no los usas?
Saludos,