haces una pregunta muy difícil amigo, mas si no pones el código en el que tienes problemas
yo te recomiendo que mejor intentes maquetar la estructura de la web sin bootstrap, por lo general crea mucho codigo y hay ocasiones en que por mas que intentes interpretarlo, tardaras mas tiempo en parchar que en haberlo hecho por tu cuenta.
es mi humilde opinión amigo, espero que te sirva