Cargar un script externo desde fuera del CMS

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Hola vuelvo a subir para decir que algo he solucionado, pero no termino de hacerlo bien, comento:
al llamar a mi función externa a joomla, esta nada mas empezar se conecta a la bd:

Código PHP:

$conexBD = mysql_connect('localhost', 'xxxxx', 'xxxxx');
        if (!$conexBD) {
                die('No se pudo conectar a la BD: ' . mysql_error());
        }
        //$prov = $prov . "db";
        mysql_select_db('misdatosexternos');
        mysql_set_charset('utf8');
 
// Seguidamente hago una consulta y cierro la conexión:
                mysql_close($conexBD);
 

Pues bien, poniendo controles y testeando he encontrado, si no me equivoco, que el problema es que joomla y este script usan la misma ¿sesión? de conexión a la Bd??
Cuando cierro con mysql_close al volver a joomla, esta sin conexión a la bd, y peta...
Después de salir de este script, añadi (ya en el cod de joomla):

Código PHP:

mysql_select_db('datosjoomla');
 

Y todo funciono correctamente.

El problema es que yo no quiero quitarle el mysql_close al script externo ya que ese script en ocasiones se lanzara desde joomla, y en otras, se llamará directamente. En el caso de joomla no me preocupa que se quede abierto, pero cuando se lanza solo el script lo correcto es que se cierre.

Y la pregunta importante, por que están utilizando la misma sesión de conexión a la bd tanto el script externo como joomla?
¿Qué se me escapa?

Gracias