Una simple solucion es utilizando el
ScripManager en el MasterPage:
Código:
<asp:ScriptManager ID="ScriptManager1" runat="server">
<Scripts>
<asp:ScriptReference Path="~/jquery-1.4.1.js" />
</Scripts>
</asp:ScriptManager>
Con esto podras mandar llamar las funciones Jquery si necesidad de volver a realizar las referencias en cada pagina.
Saludos!
