Cita: en la BD "A" tengo todos los datos y en la BD "B", no hay nada.
Parece que en B no hay nada, insisto nos falta información, obviamente si hay datos en B estariamos en el caso descrito por
@gnzsoloyo.
Incluso si no hay datos pero había en el pasado y no se ha hecho un adequado TRUCATE de las tablas para que los autoinc se reseteen a 1, tambien daria problemas segun como se importen los datos.