Hola:
En el primer mensaje leo:
Cita: ...al seleccionar este combo envía vía Ajax el Id del empleado seleccionado ...
... y luego:
Cita: ...no pudiera mandar el ID porque en realidad no existe en la página principal...
Hay algo contradictorio... de todos modos si obtienes el nombre del empleado, a la vez podrías obtener su id de la misma tabla.
Sobre la consulta, un radio es un elemento que puede suplir perfectamente a un elemento select, siempre que tengan el mismo nombre, se seleccionará uno solo, pero si quieres un comportamiento dinámico, tendrás que programarlo con javascript.
Saludos